海南大学设立“中共海南大学观澜湖校区委员会”和“观澜湖校区管理委员会”作为观澜湖校区最高管理机构，根据《海南大学党政管理机构、群团组织和教辅机构职能（海大党〔2019〕83号）》规定，管委会的主要职能包括：“负责观澜湖校区日常事务管理工作；负责统筹、协调和监督、落实相关部门对观澜湖校区的延伸管理工作；完成上级交办的其他任务。”

校区党委设书记1名，副书记2名；管委会设主任１名、副主任１名，下设1个综合综合事务科、1个后勤保障科、1个国际事务科，在学校党委和行政领导下，实行主任负责制，代表学校全面负责校区管理工作。